Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NUP188Q5SRE5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms