Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM201Q5SNT2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM201Q5SNT2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms