Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC158Q5M9N0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC158Q5M9N0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms