Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms