Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms