Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms