Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC3BQ53EP0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC3BQ53EP0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms