Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TWISTNBQ3B726 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms