Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPEL1Q2QD12 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms