Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms