Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC142Q17RM4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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