Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPROQ16827 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms