Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA9Q16795 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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