Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SSX1Q16384 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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