Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCN9AQ15858 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN9AQ15858 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms