Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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