Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFIXQ14938 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NFIXQ14938 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFIXQ14938 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIXQ14938 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIXQ14938 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIXQ14938 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIXQ14938 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIXQ14938 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIXQ14938 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NFIXQ14938 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIXQ14938 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIXQ14938 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFIXQ14938 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFIXQ14938 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
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