Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN5AQ14524 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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