Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIDRQ14159 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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