Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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