Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP1Q13829 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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