Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF5Q13568 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms