Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF1Q13351 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF1Q13351 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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