Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPA4Q13156 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPA4Q13156 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPA4Q13156 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPA4Q13156 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPA4Q13156 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPA4Q13156 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA4Q13156 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPA4Q13156 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA4Q13156 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPA4Q13156 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPA4Q13156 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPA4Q13156 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPA4Q13156 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPA4Q13156 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPA4Q13156 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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