Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP4Q13115 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms