Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPS1Q13098 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms