Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF1Q12946 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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