Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BPTFQ12830 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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