Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFCP2Q12800 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFCP2Q12800 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms