Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM27E3Q08E93 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms