Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNDQ07001 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNDQ07001 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms