Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms