Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms