Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPEQ02224 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms