Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms