Protein–RNA interactions for Protein: Q01650

SLC7A5, Large neutral amino acids transporter small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A5Q01650 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC7A5Q01650 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A5Q01650 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms