Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms