Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK6Q00534 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms