Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEP78395 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEP78395 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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