Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms