Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2HP62256 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2HP62256 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE2HP62256 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE2HP62256 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE2HP62256 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2HP62256 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms