Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STX17P56962 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STX17P56962 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX17P56962 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX17P56962 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX17P56962 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX17P56962 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX17P56962 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX17P56962 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX17P56962 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX17P56962 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX17P56962 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STX17P56962 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STX17P56962 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STX17P56962 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX17P56962 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX17P56962 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX17P56962 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX17P56962 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX17P56962 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX17P56962 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX17P56962 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX17P56962 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms