Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSCP56915 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSCP56915 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSCP56915 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSCP56915 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSCP56915 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSCP56915 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSCP56915 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSCP56915 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSCP56915 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSCP56915 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSCP56915 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSCP56915 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSCP56915 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSCP56915 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GSCP56915 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSCP56915 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSCP56915 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSCP56915 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GSCP56915 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSCP56915 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSCP56915 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GSCP56915 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GSCP56915 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSCP56915 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GSCP56915 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSCP56915 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSCP56915 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSCP56915 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSCP56915 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSCP56915 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSCP56915 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSCP56915 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSCP56915 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSCP56915 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSCP56915 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms