Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP9P55211 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP9P55211 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP9P55211 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP9P55211 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP9P55211 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP9P55211 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP9P55211 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP9P55211 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP9P55211 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP9P55211 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP9P55211 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP9P55211 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP9P55211 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP9P55211 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP9P55211 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP9P55211 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP9P55211 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP9P55211 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP9P55211 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP9P55211 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP9P55211 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP9P55211 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP9P55211 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms