Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB4P54760 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms