Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC5A3P53794 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A3P53794 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms