Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPAP53621 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPAP53621 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPAP53621 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPAP53621 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPAP53621 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPAP53621 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPAP53621 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPAP53621 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPAP53621 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPAP53621 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPAP53621 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPAP53621 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPAP53621 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPAP53621 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPAP53621 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPAP53621 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPAP53621 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPAP53621 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPAP53621 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPAP53621 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COPAP53621 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPAP53621 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPAP53621 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPAP53621 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPAP53621 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPAP53621 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPAP53621 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPAP53621 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPAP53621 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPAP53621 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPAP53621 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms