Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCNKBP51801 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms