Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT4P50991 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT4P50991 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT4P50991 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT4P50991 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT4P50991 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT4P50991 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT4P50991 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT4P50991 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT4P50991 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT4P50991 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT4P50991 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT4P50991 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT4P50991 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT4P50991 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT4P50991 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT4P50991 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT4P50991 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT4P50991 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT4P50991 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT4P50991 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT4P50991 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT4P50991 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT4P50991 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT4P50991 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT4P50991 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT4P50991 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT4P50991 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT4P50991 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT4P50991 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT4P50991 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT4P50991 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT4P50991 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT4P50991 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT4P50991 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT4P50991 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT4P50991 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT4P50991 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT4P50991 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCT4P50991 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCT4P50991 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCT4P50991 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCT4P50991 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCT4P50991 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCT4P50991 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCT4P50991 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCT4P50991 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCT4P50991 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT4P50991 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT4P50991 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms