Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms